Datuk Zaki mempunyai lebih daripada 28 tahun pengalaman bekerja dalam bidang dasar Kerajaan, strategi, kepimpinan eksekutif, keusahawanan dan hal-ehwal kawal selia. Beliau berpengalaman dalam bidang tadbir urus, kefahaman politik, pengurusan kewangan dan juga hal-hal undang-undang dan kawal selia. Sebelum ini, beliau merupakan Pengarah Urusan Knusford Berhad dan QSR Brands dan juga pernah memegang jawatan sebagai Pengarah Eksekutif Malaysian Resources Corporation Berhad. Datuk Zaki telah bertugas sebagai Ketua Unit Dasar dan Pegawai Khas kepada Perdana Menteri dari 2003 hingga 2009.